Отдел религиозного образования и катехизации создан для взаимодействии епархии с образовательными учреждениями области. Деятельность отдела строится во взаимодействии с государственными органами власти, учреждениями образования и культуры. Одними из задач являются создание системы Православного образования в епархии.
Руководитель образовательного отдела Костромской Епархии — протоиерей Виталий Шастин.

____________________________________________________________

Миссионерский отдел осуществляет свою работу по двум направлениям: миссионерская и противосектантская деятельность.  Деятельность отдела строится на взаимодействии с Синодальным миссионерским отделом; определении направлений и приоритетов миссионерской деятельности благочиний и приходов; размещении миссионерских материалов в СМИ, на улицах городов и общественных местах; привлечении учащихся духовных учебных заведений к миссионерской работе.
Руководитель миссионерского отдела Костромской Епархии — иерей Димитрий Трифонов.